Japan-Places.com প্রায় তালিকাভুক্ত করেছে 133 প্রাকৃতিক ইতিহাসের সংগ্রহশালা ভিতরে জাপান. শীর্ষ রেট করা কিছু প্রাকৃতিক ইতিহাসের সংগ্রহশালা ভিতরে জাপান হয়- লেক নোজিরি নওমানজু মিউজিয়াম, লেক নোজিরি নওমানজু মিউজিয়াম, লেক নোজিরি নওমানজু মিউজিয়াম, জেনবুদো যাদুঘর, ওমাচি আলপাইন মিউজিয়াম, ওমচি আলপাইন যাদুঘর, ওমচি আলপাইন যাদুঘর, মিয়াগি প্রিফেকচার ইজুনুমা-উচিনুমা অভয়ারণ্য কেন্দ্র, হিরওদাই প্রকৃতি পর্যবেক্ষণ কেন্দ্র & আসামা আগ্নেয়গিরি যাদুঘর.