Japan-Places.com প্রায় তালিকাভুক্ত করেছে 133 প্রাকৃতিক ইতিহাসের সংগ্রহশালা ভিতরে জাপান. শীর্ষ রেট করা কিছু প্রাকৃতিক ইতিহাসের সংগ্রহশালা ভিতরে জাপান হয়- ফুকুই প্রিফেকচারাল ডাইনোসর জাদুঘর, মিউজিয়াম পার্ক ইবারাকি প্রিফেকচার ন্যাচারাল মিউজিয়াম, মিউজিয়াম পার্ক ইবারাকি প্রিফেকচার ন্যাচারাল মিউজিয়াম, প্রাকৃতিক ইতিহাস ও মানব ইতিহাসের কিটাকিউশু মিউজিয়াম, কানাগাওয়া প্রিফেকচারাল মিউজিয়াম অফ ন্যাচারাল হিস্ট্রি, গ্রেট হানশিন-আওয়াজি ভূমিকম্প স্মৃতি বিপর্যয় হ্রাস এবং মানব সংস্কার প্রতিষ্ঠান, গুনমা যাদুঘর প্রাকৃতিক ইতিহাস, মি প্রিফেকচারাল মিউজিয়াম, সাইতামা প্রিফেকচারাল মিউজিয়াম অফ নেচার & ওয়াকায়ামা প্রিফেকচারাল মিউজিয়াম অফ ন্যাচারাল হিস্ট্রি.