Japan-Places.com প্রায় তালিকাভুক্ত করেছে 164 প্রত্নতাত্ত্বিক সংগ্রহশালা ভিতরে জাপান. শীর্ষ রেট করা কিছু প্রত্নতাত্ত্বিক সংগ্রহশালা ভিতরে জাপান হয়- জোমন সংস্কৃতির শাকাডো জাদুঘর, ইয়ায়োই সংস্কৃতির ওসাকা প্রিফেকচারাল মিউজিয়াম, জোমন জিউকান, ওয়াকায়ামা প্রিফেকচার কি-ফুডোকি-নো-ওকা মিউজিয়াম অফ আর্কিওলজি অ্যান্ড ফোকলোর, ইবুসুকি প্রত্নতাত্ত্বিক যাদুঘর, কুমামোটো প্রিফেকচারাল প্রাচীন সমাধি ঢিবি যাদুঘর, শিজুওকা সিটি তোরো মিউজিয়াম, ওজুকা-কোফুন, ওয়াকাসা মিকাতা জোমন মিউজিয়াম ডকিডোকি বিল্ডিং & শিবায়ামা কোফুন হানিওয়া মিউজিয়াম.